79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0276 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
168 aa  326  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  86.75 
 
 
171 aa  287  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  46.95 
 
 
165 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  47.02 
 
 
167 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  47.59 
 
 
165 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  44.83 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  44.83 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  40.72 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  44.6 
 
 
144 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  42.31 
 
 
205 aa  92  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  39.13 
 
 
231 aa  91.3  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  41.5 
 
 
177 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  44.36 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  41.5 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  42.45 
 
 
215 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  41.5 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  34.87 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  41.5 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  35.92 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  43.07 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  39.69 
 
 
186 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  38.24 
 
 
219 aa  84.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  41.79 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  37.11 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  43.08 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  36.81 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  39.13 
 
 
220 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  41.79 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  41.3 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  39.29 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  34.64 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  38.03 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  34.64 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  36.48 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  48.45 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  36.16 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  36.16 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  37.29 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  35.9 
 
 
228 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  42.42 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  37.58 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  33.97 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  34.52 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  31.17 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  29.48 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  43.48 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  29.2 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  34.21 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  31.55 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  32.14 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  33.13 
 
 
228 aa  64.3  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  34.67 
 
 
250 aa  64.3  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  31.62 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  29.61 
 
 
525 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  36.2 
 
 
649 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  31.03 
 
 
180 aa  60.8  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  34.46 
 
 
236 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  30.71 
 
 
233 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  36.36 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  55.36 
 
 
420 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  35.03 
 
 
659 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  32.47 
 
 
661 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  32.47 
 
 
661 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  33.13 
 
 
213 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 
579 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  31.33 
 
 
645 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  31.33 
 
 
645 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  31.33 
 
 
645 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  28.87 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  34.36 
 
 
526 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  34.36 
 
 
526 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  34.36 
 
 
526 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  33.12 
 
 
659 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  34.07 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  32.08 
 
 
206 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  31.85 
 
 
646 aa  51.2  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  35.56 
 
 
600 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  29.75 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  0.0000000000000124993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  35.11 
 
 
612 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>