80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0177 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  50.36 
 
 		 988 aa  830    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  90.87 
 
 		 1000 aa  1717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  100 
 
 		 997 aa  1932    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  50.2 
 
 		 980 aa  759    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  56.07 
 
 		 977 aa  998    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  48.94 
 
 		 986 aa  825    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  98.8 
 
 		 997 aa  1911    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  37.54 
 
 		 1001 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.25 
 
 		 1042 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  36.83 
 
 		 999 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  35.11 
 
 		 1048 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1049 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  33.52 
 
 		 1052 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  34.77 
 
 		 1052 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1018 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  34.79 
 
 		 1049 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  34.77 
 
 		 1052 aa  376  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  32.62 
 
 		 1062 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  36.84 
 
 		 991 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  34.6 
 
 		 1049 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  32.56 
 
 		 1059 aa  365  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  32.18 
 
 		 1064 aa  364  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1016 aa  363  9e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  35.86 
 
 		 1042 aa  361  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  32.03 
 
 		 1064 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  35.92 
 
 		 1015 aa  359  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  34.14 
 
 		 1048 aa  354  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  33.55 
 
 		 1043 aa  349  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  30.73 
 
 		 1047 aa  347  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  35.67 
 
 		 1037 aa  346  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  31.81 
 
 		 1076 aa  340  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  35.68 
 
 		 1054 aa  330  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.13 
 
 		 993 aa  313  7.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  33.66 
 
 		 991 aa  310  8e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  33.27 
 
 		 1014 aa  305  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1053 aa  250  8e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  39.43 
 
 		 1047 aa  241  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  39.21 
 
 		 1047 aa  240  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  40.4 
 
 		 1045 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  35.25 
 
 		 959 aa  237  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  36.74 
 
 		 1040 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.35 
 
 		 890 aa  131  7.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  18.91 
 
 		 914 aa  121  7e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  18.74 
 
 		 911 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  26.77 
 
 		 864 aa  72.8  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  25.37 
 
 		 976 aa  72.8  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.02 
 
 		 780 aa  65.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.5 
 
 		 781 aa  62  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.67 
 
 		 1048 aa  61.6  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  26.78 
 
 		 962 aa  61.6  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  26.74 
 
 		 779 aa  61.6  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.46 
 
 		 856 aa  58.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28 
 
 		 947 aa  58.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.22 
 
 		 915 aa  57.4  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  31.1 
 
 		 1106 aa  57  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.34 
 
 		 855 aa  56.2  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  33.14 
 
 		 299 aa  55.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.35 
 
 		 989 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.96 
 
 		 919 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.02 
 
 		 836 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.79 
 
 		 781 aa  53.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  28.92 
 
 		 951 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  26.05 
 
 		 333 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  22.37 
 
 		 1077 aa  51.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  28.69 
 
 		 865 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.54 
 
 		 958 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  28.51 
 
 		 323 aa  50.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  23.28 
 
 		 786 aa  49.3  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.76 
 
 		 957 aa  49.7  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  32.02 
 
 		 896 aa  49.3  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.55 
 
 		 1016 aa  48.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  29.28 
 
 		 846 aa  48.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  28.82 
 
 		 912 aa  47.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  26.5 
 
 		 913 aa  47.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.33 
 
 		 916 aa  47  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  30.17 
 
 		 298 aa  46.2  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  28.66 
 
 		 273 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  20 
 
 		 794 aa  45.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  27.78 
 
 		 291 aa  45.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  26.89 
 
 		 304 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>