57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0173 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2956  PAS domain-containing protein  83.85 
 
 		 520 aa  856    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0889677  normal  0.0630855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0173  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1019    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0132875  normal  0.889008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1521  hypothetical protein  99.23 
 
 		 520 aa  1010    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2778  putative PAS/PAC sensor protein  44.78 
 
 		 531 aa  342  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.866604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2841  hypothetical protein  37.92 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3433  putative PAS/PAC sensor protein  46.22 
 
 		 434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4061  putative PAS/PAC sensor protein  38.92 
 
 		 549 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 830 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 829 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 830 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 837 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  26.33 
 
 		 835 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  27.32 
 
 		 837 aa  124  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  27.32 
 
 		 859 aa  123  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 837 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  25.27 
 
 		 858 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 857 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 770 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  23.74 
 
 		 824 aa  121  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  24.93 
 
 		 838 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 842 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  28.9 
 
 		 846 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  24.79 
 
 		 826 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 837 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 843 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 861 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  25.91 
 
 		 911 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  28.42 
 
 		 837 aa  114  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 861 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 862 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 861 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 859 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 838 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 843 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  28.51 
 
 		 903 aa  97.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 798 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 782 aa  93.6  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 787 aa  93.6  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 801 aa  90.5  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.92 
 
 		 727 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3588  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.1 
 
 		 827 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0360121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 1603 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.66 
 
 		 1419 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0512  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 945 aa  47  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 851 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  32.09 
 
 		 851 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.56 
 
 		 1330 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  32.09 
 
 		 851 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000223104  hitchhiker  0.0000247295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  23.28 
 
 		 1055 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2444  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.51 
 
 		 673 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2164  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 		 941 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0320639 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1952  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.1 
 
 		 545 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0079  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.61 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  23.16 
 
 		 888 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>