49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0150 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0150  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 180 aa  350  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1500  anti-sigma regulatory kinase  96.11 
 
 		 180 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2905  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.88 
 
 		 149 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.94653  normal  0.27326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4052  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  41.35 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.55 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0072  serine-protein kinase  40.15 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 570 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 147 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0819  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.13 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  23.89 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  23.89 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  26.6 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  27.66 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  26.6 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 286 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1701  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 731 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3443  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  33.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 721 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  25.26 
 
 		 159 aa  42  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 709 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  27.55 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.35 
 
 		 437 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00177  DNA topoisomerase IV subunit B  36.17 
 
 		 629 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771486  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0612  DNA topoisomerase IV subunit B  36.17 
 
 		 629 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0564  DNA topoisomerase IV subunit B  36.17 
 
 		 629 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 431 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 493 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 511 aa  41.2  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  24.06 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2936  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>