86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0126 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  76.94 
 
 		 413 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  80.83 
 
 		 426 aa  712    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  74.51 
 
 		 412 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  81.55 
 
 		 413 aa  718    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  77.91 
 
 		 413 aa  685    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  100 
 
 		 412 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  74.82 
 
 		 422 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  81.55 
 
 		 413 aa  717    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  73.77 
 
 		 413 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  95.15 
 
 		 412 aa  814    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 412 aa  850    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  77.56 
 
 		 407 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  72.88 
 
 		 424 aa  631  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  73.12 
 
 		 424 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  71.81 
 
 		 414 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  71.81 
 
 		 414 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  69.66 
 
 		 412 aa  608  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  70.99 
 
 		 399 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  70.74 
 
 		 399 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  48.38 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  46.93 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  46.75 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  44.64 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  45.57 
 
 		 414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  46.85 
 
 		 401 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  45.27 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  45.23 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  45.27 
 
 		 398 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  42.96 
 
 		 398 aa  349  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  44.39 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  44.03 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  43.78 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  43.81 
 
 		 396 aa  339  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  41.99 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  44.58 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  44.19 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  42.68 
 
 		 409 aa  335  7.999999999999999e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  41 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  42.96 
 
 		 400 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  45.14 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  42.46 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  41 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  42.39 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  40.75 
 
 		 401 aa  332  6e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  44.47 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  40.75 
 
 		 401 aa  332  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  43.61 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  41.89 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  42.57 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  43.22 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  40.66 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  41.67 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  41.12 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  44.78 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  43.38 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  39.8 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  40.75 
 
 		 405 aa  315  8e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  44.03 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  40.3 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  44.03 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  41.35 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  39.71 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  37.84 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  30.73 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  28.9 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  31.93 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  28.71 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.29 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.29 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  27.12 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  23.96 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.01 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  24.56 
 
 		 486 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  26 
 
 		 367 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  28.1 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  21.55 
 
 		 469 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  34.21 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  21.55 
 
 		 469 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  23.98 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  20.09 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.09 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  26.32 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>