More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0094 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  98.91 
 
 		 367 aa  728    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  70.3 
 
 		 370 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  55.19 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  54.1 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  57.19 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  57.19 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  54.89 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  52.78 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.86 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  53.41 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.14 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  53.93 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  50.95 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  57.19 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 381 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  57.91 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.59 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.13 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.13 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  52.5 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  55.94 
 
 		 369 aa  362  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  55.15 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  55.06 
 
 		 376 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.86 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  53.72 
 
 		 369 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 		 373 aa  362  8e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  54.78 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  52.88 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  51.9 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  55.59 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  54.34 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  50.82 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  51.51 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.86 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  52.66 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  53.89 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  51.51 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  54.9 
 
 		 367 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  50.96 
 
 		 359 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  51.77 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  50.41 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.19 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  56.04 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  55.66 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.37 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  50.68 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  49.34 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  49.87 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.07 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.34 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  50.96 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  51.78 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  51.24 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  51.36 
 
 		 370 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6323  ABC transporter related  51.99 
 
 		 384 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.46 
 
 		 371 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  51.09 
 
 		 354 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  50.82 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.59 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.63 
 
 		 369 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  50.83 
 
 		 368 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  52.25 
 
 		 384 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  50.56 
 
 		 363 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  52.58 
 
 		 374 aa  347  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  52.33 
 
 		 330 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  53.01 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  53.87 
 
 		 381 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  51.23 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  54.43 
 
 		 381 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.94 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  54.66 
 
 		 357 aa  346  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  52.76 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.94 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.94 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  50.28 
 
 		 363 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>