More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0087 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  98.94 
 
 
658 aa  1164    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 
658 aa  1176    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  59.54 
 
 
656 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.15 
 
 
665 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.78 
 
 
656 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.04 
 
 
659 aa  369  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  40.83 
 
 
658 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.28 
 
 
662 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.97 
 
 
639 aa  349  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.73 
 
 
665 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.73 
 
 
665 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.73 
 
 
670 aa  341  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.41 
 
 
685 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.41 
 
 
685 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.09 
 
 
685 aa  334  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.25 
 
 
685 aa  334  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.25 
 
 
685 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.39 
 
 
655 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.25 
 
 
660 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.35 
 
 
660 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.25 
 
 
660 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  40.25 
 
 
660 aa  324  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.09 
 
 
660 aa  324  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.09 
 
 
660 aa  324  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.94 
 
 
660 aa  323  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  40.09 
 
 
660 aa  323  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.57 
 
 
660 aa  323  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  40.09 
 
 
660 aa  323  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.81 
 
 
672 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.39 
 
 
672 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  46.12 
 
 
657 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  44.9 
 
 
669 aa  310  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.51 
 
 
662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.31 
 
 
694 aa  300  8e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.44 
 
 
676 aa  289  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.25 
 
 
665 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.12 
 
 
678 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.04 
 
 
670 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.49 
 
 
678 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.96 
 
 
678 aa  266  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.08 
 
 
671 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.32 
 
 
678 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.32 
 
 
678 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.57 
 
 
678 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.57 
 
 
677 aa  262  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.57 
 
 
678 aa  260  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.74 
 
 
644 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.49 
 
 
664 aa  246  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  31.25 
 
 
655 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.39 
 
 
653 aa  233  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.44 
 
 
668 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.17 
 
 
704 aa  204  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.75 
 
 
658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.49 
 
 
709 aa  191  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  32.56 
 
 
700 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4271  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.35 
 
 
645 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192247  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4123  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.35 
 
 
645 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.56 
 
 
697 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.64 
 
 
659 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.79 
 
 
704 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.15 
 
 
697 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.99 
 
 
696 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.09 
 
 
708 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.99 
 
 
696 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.33 
 
 
696 aa  150  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.28 
 
 
702 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.44 
 
 
677 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.44 
 
 
696 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.31 
 
 
706 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.31 
 
 
706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.31 
 
 
706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.31 
 
 
706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.31 
 
 
706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  33.81 
 
 
700 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.48 
 
 
696 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.15 
 
 
706 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.15 
 
 
706 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1395  iron compound ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
333 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  33.1 
 
 
337 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
338 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  32.74 
 
 
337 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  32.71 
 
 
338 aa  132  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.58 
 
 
338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.58 
 
 
338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.58 
 
 
338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.58 
 
 
338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1389  iron (III) ABC transporter, permease  33.53 
 
 
332 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.953687  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.53 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.99 
 
 
708 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01764  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  34.83 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.5 
 
 
452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  37.5 
 
 
315 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  35.17 
 
 
330 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.49 
 
 
367 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  35.52 
 
 
318 aa  127  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  33.75 
 
 
708 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>