142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0067 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  99.3 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  90.91 
 
 		 286 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  60.28 
 
 		 287 aa  362  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  58.39 
 
 		 286 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  57.09 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  50.75 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  46.4 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  47.25 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  45.9 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  41.78 
 
 		 296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  43.46 
 
 		 293 aa  224  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  40.61 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  43.54 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  45.52 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  41.97 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  44.09 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  41.69 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  40.61 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  43.49 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  40.59 
 
 		 298 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  44.36 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  40.59 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  41.55 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  41.2 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  41.24 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  40.07 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  40.35 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  38.91 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  38.91 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  45.83 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  38.27 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  37.86 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  39.19 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  39.02 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  38.74 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  37.41 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  35.25 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  34.75 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  36.23 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  36.63 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  37.65 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  35.41 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  33.84 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  35.61 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  38.21 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  32.2 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  36.02 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  36.02 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  36.02 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  37.65 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  37.65 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  35.63 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.63 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.63 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  34.73 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  31.21 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  31.07 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  31.87 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  33.21 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  33.6 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  29.88 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  30.2 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  31.25 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  33.19 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  29.11 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  30.96 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30.51 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  31.51 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  31.39 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.08 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  29.66 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  31.58 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  32.77 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  30.67 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  28.39 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  28.81 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  26.79 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  27.76 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  28.52 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  28.28 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  29.6 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  29.41 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  29.34 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  30.16 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  25.6 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  28.85 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.38 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>