44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0051 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  91.48 
 
 
176 aa  310  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  66.67 
 
 
182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  60.23 
 
 
175 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  60 
 
 
177 aa  195  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  59.48 
 
 
175 aa  181  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  47.14 
 
 
168 aa  141  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  36.94 
 
 
173 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  35.53 
 
 
178 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  34.88 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  35.47 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  35.38 
 
 
182 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  33.08 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  32.35 
 
 
190 aa  87.8  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  30.64 
 
 
167 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  29.66 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  30.06 
 
 
167 aa  84.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  33.72 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  34.78 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  32.18 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  30.99 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  29.46 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  30.71 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  29.23 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  31.58 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  26.92 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  30.95 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  29.35 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  30.38 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  31.85 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  31.85 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  26.22 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  27.44 
 
 
203 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  29.94 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  27.49 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  25.75 
 
 
167 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  26.19 
 
 
166 aa  50.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  27.67 
 
 
165 aa  47.8  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  31.4 
 
 
165 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  22.14 
 
 
162 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.577158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>