146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0019 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  99.74 
 
 
385 aa  771    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0813  phosphoserine aminotransferase  86.02 
 
 
384 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
385 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  95.73 
 
 
385 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  76.33 
 
 
389 aa  591  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  78.78 
 
 
384 aa  589  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  74.27 
 
 
381 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  71.94 
 
 
392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  70.33 
 
 
391 aa  551  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  70.84 
 
 
392 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  70.33 
 
 
391 aa  552  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  70.92 
 
 
392 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  71.1 
 
 
391 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  72.44 
 
 
392 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  71.95 
 
 
390 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6395  phosphoserine aminotransferase  71.95 
 
 
390 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  69.87 
 
 
390 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  67.44 
 
 
390 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  67.01 
 
 
390 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  69.61 
 
 
390 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 
389 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  68.57 
 
 
390 aa  524  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  68.05 
 
 
385 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  68.31 
 
 
389 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  68.57 
 
 
390 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  70.39 
 
 
391 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 
390 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  68.7 
 
 
385 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  70.13 
 
 
390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  68.05 
 
 
390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  68.57 
 
 
390 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  67.57 
 
 
371 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  68.34 
 
 
391 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  68.07 
 
 
391 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  68.07 
 
 
391 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  64.63 
 
 
399 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  63.64 
 
 
376 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0271  phosphoserine aminotransferase  62.76 
 
 
384 aa  493  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  63.49 
 
 
379 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  64.05 
 
 
395 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  62.47 
 
 
391 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  62.1 
 
 
370 aa  480  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1104  phosphoserine aminotransferase  64.57 
 
 
384 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  65.69 
 
 
396 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  59.73 
 
 
372 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  60.21 
 
 
392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  62.89 
 
 
393 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  58.87 
 
 
374 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  59.42 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  50.79 
 
 
410 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.94 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  28.03 
 
 
382 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  29.18 
 
 
375 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  27.72 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  28.39 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  27.68 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  28.38 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  27.78 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  27.03 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  26.17 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  28.34 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  27.85 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  27.81 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  27.75 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  28.39 
 
 
370 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  28.39 
 
 
370 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  28.39 
 
 
370 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  26.49 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 
373 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  28.5 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  26.46 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  25.87 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  26.08 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  27.95 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  27.85 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  26.19 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  25.65 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  26.12 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  26.67 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  26.61 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  25.71 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  25.91 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  26.09 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  24.87 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  25.34 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  26.19 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4249  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  27.37 
 
 
993 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0684  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  27.44 
 
 
991 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395395  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  24.05 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  24.59 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0619  phosphoserine aminotransferase  23.23 
 
 
365 aa  56.6  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  23.61 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  22.51 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  23.46 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0122  phosphoserine aminotransferase  25.85 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>