More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0018 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
291 aa  582  1e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  97.25 
 
 
291 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  93.1 
 
 
291 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  75.79 
 
 
292 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  71.72 
 
 
291 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  63.67 
 
 
291 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  60.14 
 
 
291 aa  320  1e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  56.64 
 
 
296 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  53.24 
 
 
295 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  56.64 
 
 
296 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  55.59 
 
 
296 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 
299 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  56.16 
 
 
297 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  54.61 
 
 
297 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  54.55 
 
 
299 aa  286  3e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 
299 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 
295 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  52.72 
 
 
298 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  53.58 
 
 
296 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  51.51 
 
 
309 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 
296 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  54.58 
 
 
297 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  53.4 
 
 
298 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  53.38 
 
 
298 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  53.04 
 
 
298 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  54.24 
 
 
297 aa  266  3e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  62.95 
 
 
226 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  59.73 
 
 
289 aa  261  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  54.76 
 
 
298 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  52.88 
 
 
299 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  51.21 
 
 
332 aa  253  2e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  60.53 
 
 
241 aa  251  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
299 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  49.83 
 
 
325 aa  244  2e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  50.17 
 
 
297 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.93 
 
 
292 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 
298 aa  234  1e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 
294 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 
432 aa  197  2e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  44.03 
 
 
275 aa  196  4e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  47.42 
 
 
398 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  47.27 
 
 
307 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  45.65 
 
 
419 aa  182  4e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
403 aa  182  5e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
284 aa  182  5e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 
429 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  38.75 
 
 
302 aa  181  9e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  40.5 
 
 
285 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  40.21 
 
 
310 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  41.67 
 
 
285 aa  179  6e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  47.22 
 
 
419 aa  175  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.06 
 
 
279 aa  173  3e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.89 
 
 
279 aa  173  3e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
297 aa  173  4e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.59 
 
 
435 aa  172  4e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 
279 aa  173  4e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  43.83 
 
 
281 aa  172  4e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  43.39 
 
 
406 aa  171  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  42.73 
 
 
278 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.07909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  47.6 
 
 
236 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  43.7 
 
 
281 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  47.29 
 
 
316 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  41.9 
 
 
410 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 
281 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.02 
 
 
429 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.02 
 
 
404 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 
316 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 
316 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 
281 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.01 
 
 
404 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  43.4 
 
 
327 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  43.04 
 
 
281 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 
400 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  44.59 
 
 
372 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.17789e-07  unclonable  3.04475e-11 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  44.71 
 
 
326 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  43.95 
 
 
279 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.71 
 
 
325 aa  166  3e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  44.71 
 
 
326 aa  166  3e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  50.71 
 
 
294 aa  166  3e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
235 aa  166  3e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  44.71 
 
 
326 aa  166  3e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  39.47 
 
 
404 aa  166  3e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 
400 aa  166  3e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  41.09 
 
 
420 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
237 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  46.89 
 
 
241 aa  166  6e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  41.53 
 
 
281 aa  165  7e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  41.53 
 
 
281 aa  165  7e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  41.53 
 
 
281 aa  165  7e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  41.53 
 
 
281 aa  165  7e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  44.83 
 
 
454 aa  165  7e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 
404 aa  165  7e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  41.53 
 
 
281 aa  165  7e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  46.08 
 
 
357 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 
415 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 
326 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  40.93 
 
 
407 aa  164  1e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  45.67 
 
 
237 aa  165  1e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  40.32 
 
 
398 aa  164  1e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  40.32 
 
 
418 aa  164  1e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>