78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4364 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  974    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  30.77 
 
 		 479 aa  246  8e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  31.08 
 
 		 481 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  31.7 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  33.03 
 
 		 482 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  32 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  28.74 
 
 		 328 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.46 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  29.46 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  29.46 
 
 		 613 aa  80.1  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  26.73 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  31.44 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  30.54 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  25.95 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  26.96 
 
 		 272 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  30.57 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.61 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  26.24 
 
 		 906 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  29.73 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  25.38 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  29.73 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.88 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  25 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  27.96 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  29.91 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  26.34 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  27.51 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.91 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  24.78 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  24.02 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  25.23 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  22.51 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1199 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  27.94 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  25.32 
 
 		 540 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  24.48 
 
 		 516 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  25.74 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  25 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  21.21 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  26.39 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4272  hypothetical protein  23.64 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  28.86 
 
 		 305 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  22.61 
 
 		 524 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  26.36 
 
 		 716 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  24.55 
 
 		 606 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  27.56 
 
 		 377 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1161 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  25.69 
 
 		 306 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  25.09 
 
 		 461 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  31.48 
 
 		 480 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1160 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1170 aa  53.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1170 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1160 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  25.93 
 
 		 409 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  28.81 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  25.38 
 
 		 541 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  28.83 
 
 		 746 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1160 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  25.23 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  24.56 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1160 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  30.19 
 
 		 321 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1160 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  25.23 
 
 		 306 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  31.43 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1166 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1319 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  25.94 
 
 		 459 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 1036 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  20.56 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  29.17 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  23.53 
 
 		 293 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2247  hypothetical protein  23.36 
 
 		 351 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0221493  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  23.55 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  23.55 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  25.64 
 
 		 538 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  25.64 
 
 		 538 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>