More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4356 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1258    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  38.7 
 
 		 689 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  37.03 
 
 		 682 aa  273  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  36.6 
 
 		 671 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  51.03 
 
 		 788 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  37.35 
 
 		 639 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  47.54 
 
 		 743 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  38.92 
 
 		 744 aa  256  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  49.82 
 
 		 680 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  37.52 
 
 		 687 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  38.79 
 
 		 787 aa  252  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  43.81 
 
 		 697 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  52.65 
 
 		 619 aa  243  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  47.04 
 
 		 698 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  34.74 
 
 		 634 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  36.06 
 
 		 657 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  46.49 
 
 		 665 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  43.48 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  42.43 
 
 		 656 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  46.43 
 
 		 653 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  42.07 
 
 		 656 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  42.17 
 
 		 725 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  49.6 
 
 		 646 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 		 749 aa  218  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  37.43 
 
 		 1085 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  45.17 
 
 		 450 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  44.4 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  47.49 
 
 		 441 aa  213  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  49.42 
 
 		 450 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  49.21 
 
 		 444 aa  210  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  47.3 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  44.79 
 
 		 448 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  47.08 
 
 		 448 aa  207  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  44.79 
 
 		 478 aa  207  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  40.84 
 
 		 434 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  44.49 
 
 		 662 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  47.06 
 
 		 697 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  41.98 
 
 		 466 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  41.02 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  49.04 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  38.82 
 
 		 450 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  40.66 
 
 		 1193 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  47.53 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  38.63 
 
 		 622 aa  177  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  45.78 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 678 aa  161  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  39.35 
 
 		 352 aa  152  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  37.85 
 
 		 305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  54.03 
 
 		 134 aa  144  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  40.09 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.6 
 
 		 570 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  29.88 
 
 		 570 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.6 
 
 		 570 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  32.82 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.2 
 
 		 570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  28.76 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.41 
 
 		 299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  36.36 
 
 		 228 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  33.61 
 
 		 443 aa  118  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.2 
 
 		 577 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.9 
 
 		 569 aa  115  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  34.86 
 
 		 617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  39.04 
 
 		 348 aa  104  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  34.05 
 
 		 335 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  31.77 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  33.62 
 
 		 332 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 		 425 aa  97.8  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  39.85 
 
 		 328 aa  97.4  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  36.87 
 
 		 773 aa  97.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  37.31 
 
 		 328 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  32.77 
 
 		 335 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  36.87 
 
 		 773 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 		 424 aa  95.1  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  36.31 
 
 		 771 aa  94.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  38.06 
 
 		 775 aa  94.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  30.99 
 
 		 335 aa  94  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  42.22 
 
 		 789 aa  94  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  33.72 
 
 		 326 aa  94  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  33 
 
 		 360 aa  94  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  28.99 
 
 		 327 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  36.21 
 
 		 322 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  34.68 
 
 		 772 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  38.78 
 
 		 771 aa  92.8  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  33.91 
 
 		 328 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  43.08 
 
 		 795 aa  92  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  30.57 
 
 		 326 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  34.46 
 
 		 327 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  34.46 
 
 		 327 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  32.09 
 
 		 330 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.73 
 
 		 451 aa  90.9  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  35.47 
 
 		 355 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  36.7 
 
 		 776 aa  90.5  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  33.18 
 
 		 468 aa  90.5  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  39.86 
 
 		 308 aa  90.5  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  36.49 
 
 		 459 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  41.48 
 
 		 789 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  29.37 
 
 		 329 aa  89.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  29.37 
 
 		 329 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  31.84 
 
 		 426 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.88 
 
 		 477 aa  89.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>