203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4228 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4228  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.988743 
 
 
-
 
NC_004310  BR1853  AzlC family protein  47.12 
 
 
224 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  38.21 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  38.21 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  38.21 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  38.68 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  36.41 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  36.41 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  36.41 
 
 
245 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  36.41 
 
 
245 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  34.12 
 
 
240 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  35.94 
 
 
245 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  35.94 
 
 
245 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  35.94 
 
 
245 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  35.94 
 
 
245 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  35.94 
 
 
245 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  37.36 
 
 
246 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  36.81 
 
 
243 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  37.93 
 
 
237 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  35.4 
 
 
250 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  31.6 
 
 
240 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  36.4 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  32.16 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  34.29 
 
 
240 aa  88.2  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  35.32 
 
 
282 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  30.4 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.05 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  34.86 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.59 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.05 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  30.87 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.14 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.59 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.59 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.59 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  30.65 
 
 
233 aa  82  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.59 
 
 
241 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  30.59 
 
 
241 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.86 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  29.38 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  30.73 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  29.41 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  32.64 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  30.96 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  28.57 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  34.36 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  31.65 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  31.46 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  27.5 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  30 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  28.36 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.88 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  30.85 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  31.38 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  27.78 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  27.78 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  27.78 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  26.91 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  31.76 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  28.65 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  28.91 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  32.18 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.72 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  32.58 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  30.89 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  31.15 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  32.58 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  28.91 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  29.24 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  28.91 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  35.37 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.91 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  26.18 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  32.88 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  32.37 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  28.72 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  31.52 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  28.72 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  30.16 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30.56 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  29.19 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0648  AzlC family protein  27.27 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000031666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  26.83 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  32.37 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  31.11 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  28.86 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  29.1 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.03 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  24.11 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.88 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  27.62 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  28.49 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  28.57 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  30.65 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  29.53 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.67 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  28.44 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  32.24 
 
 
292 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  31.69 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  32.93 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>