81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4162 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  69.61 
 
 		 105 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  58.82 
 
 		 105 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.76 
 
 		 104 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  59.8 
 
 		 104 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  59.8 
 
 		 104 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  51.4 
 
 		 104 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.57 
 
 		 105 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.66 
 
 		 108 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.57 
 
 		 105 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.49 
 
 		 102 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.57 
 
 		 105 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.75 
 
 		 105 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.59 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.54 
 
 		 105 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.71 
 
 		 107 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.57 
 
 		 106 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.48 
 
 		 121 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  36.45 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.39 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.94 
 
 		 130 aa  62  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.53 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.43 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.68 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.89 
 
 		 124 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  30.89 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 		 131 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.08 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  30.58 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.19 
 
 		 114 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.98 
 
 		 107 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  42.17 
 
 		 141 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3165  putative HNS-like transcription regulator protein  34.19 
 
 		 118 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480481 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  35.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  35.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  35.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  35.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  35.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  35.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  35.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 119 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  34.65 
 
 		 125 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 97 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 97 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 97 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 97 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 97 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 97 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  33.01 
 
 		 102 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.03 
 
 		 96 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 		 100 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  34.07 
 
 		 100 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 97 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  26.77 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.35 
 
 		 102 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.19 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0416  nucleoid protein H-NS  31.25 
 
 		 114 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193878  hitchhiker  0.00866736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.98 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.98 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1598  nucleoid protein H-NS  51.16 
 
 		 117 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.98 
 
 		 130 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.29 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  32.41 
 
 		 96 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0519  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000291454  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.56 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.25 
 
 		 103 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.32 
 
 		 91 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2688  hypothetical protein  45.71 
 
 		 110 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.299941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.21 
 
 		 139 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.18 
 
 		 100 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2911  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.97 
 
 		 114 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.18 
 
 		 100 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.93 
 
 		 92 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  32.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  55.56 
 
 		 123 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  30.11 
 
 		 123 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  32.18 
 
 		 100 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>