More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3913 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  75.53 
 
 
425 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  869    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  70.26 
 
 
430 aa  614  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  65.13 
 
 
425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  62.56 
 
 
431 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  64.36 
 
 
425 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  66.58 
 
 
440 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  65.81 
 
 
427 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  63.64 
 
 
430 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  57.36 
 
 
437 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  52.19 
 
 
453 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.57 
 
 
414 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  51.16 
 
 
451 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  51.16 
 
 
449 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  51.04 
 
 
445 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  51.02 
 
 
449 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  45.79 
 
 
445 aa  381  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.95 
 
 
451 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.06 
 
 
456 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  47.85 
 
 
437 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  48.39 
 
 
424 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.39 
 
 
418 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.39 
 
 
418 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  48.88 
 
 
418 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  46.79 
 
 
448 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  48.66 
 
 
406 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  49.48 
 
 
419 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  48.94 
 
 
409 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  46.54 
 
 
443 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  47.72 
 
 
423 aa  355  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  47.87 
 
 
414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  48.15 
 
 
429 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  47.22 
 
 
457 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  45.23 
 
 
457 aa  349  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  43.46 
 
 
425 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  46.47 
 
 
431 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  46.52 
 
 
406 aa  322  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  46.52 
 
 
402 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  47.55 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  47.55 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  43.3 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.38 
 
 
425 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  43.48 
 
 
431 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  42.79 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  40.8 
 
 
414 aa  299  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.7 
 
 
415 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  44.98 
 
 
405 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  37.94 
 
 
427 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 
369 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 
369 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 
369 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.76 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.86 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  34.53 
 
 
338 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.54 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.68 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.21 
 
 
414 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.89 
 
 
372 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  30.29 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  32.39 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  34.69 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  27.5 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.92 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
410 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.03 
 
 
411 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
402 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 
402 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 
403 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  31.96 
 
 
370 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 
461 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  28.08 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.57 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.96 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.33 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
412 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.41 
 
 
417 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 
405 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 
405 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.97 
 
 
410 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.89 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.18 
 
 
434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  30.7 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.38 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  28.35 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.21 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.82 
 
 
511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.58 
 
 
465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  27.19 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.06 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.27 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.13 
 
 
400 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.5 
 
 
407 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.75 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  29.69 
 
 
407 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.9 
 
 
405 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>