More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3875 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  620  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  91.11 
 
 		 315 aa  540  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  90.79 
 
 		 315 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  61.76 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  60.64 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  60 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  63.81 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  46.83 
 
 		 319 aa  215  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  42.06 
 
 		 373 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  42.09 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  42.71 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  41.97 
 
 		 382 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  41.97 
 
 		 382 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  36.23 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  46.83 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  47.27 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  40.13 
 
 		 377 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  42.02 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  38.95 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  42.32 
 
 		 345 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  39.19 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  38.46 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  38.81 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  41.39 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  37.83 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  38.15 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  36.81 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  37.99 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  37.99 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  37.99 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  37.99 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 		 291 aa  169  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  39.26 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.76 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  41.15 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  41.45 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  38.08 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 		 373 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  41.9 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.87 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.54 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  35.62 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  33.23 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  34.49 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  35.54 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  38.53 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  40.36 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  32.49 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.92 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.66 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  34.2 
 
 		 285 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  32.51 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  39.06 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.45 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  43.05 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  36.51 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  38.01 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  48.3 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  38.63 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.11 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  34.59 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  34.4 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  35.86 
 
 		 295 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  35.86 
 
 		 295 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  33.09 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  33.09 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  35.22 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  33.47 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  33.69 
 
 		 281 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  36.41 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  32.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.97 
 
 		 439 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  34.32 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  34.32 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  34.32 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  33.05 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  36.69 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  31.65 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>