More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3787 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  100 
 
 
229 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 
222 aa  234  1e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.18 
 
 
230 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 
231 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  46.46 
 
 
231 aa  212  4e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 
241 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  47.79 
 
 
230 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 
231 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 
231 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  46.46 
 
 
230 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  47.6 
 
 
232 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  51.11 
 
 
228 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  44.84 
 
 
230 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
230 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  47.53 
 
 
230 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
230 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 
230 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
227 aa  201  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
235 aa  201  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  50 
 
 
231 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1510  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
224 aa  199  2e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.963665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 
231 aa  200  2e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
228 aa  199  2e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  199  2e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 
235 aa  199  2e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  199  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 
231 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 
231 aa  199  4e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  199  4e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  199  4e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  199  4e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
229 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76822e-06 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 
230 aa  197  1e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
229 aa  197  1e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
235 aa  197  1e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  49.55 
 
 
240 aa  196  2e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
232 aa  197  2e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 
230 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
229 aa  195  4e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52099e-07 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
228 aa  195  5e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
235 aa  194  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
230 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
229 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 
232 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
229 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 
230 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 
232 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
233 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  47.98 
 
 
244 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  47.11 
 
 
232 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  47.11 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  47.11 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  47.11 
 
 
232 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  47.11 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  47.11 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 
230 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  47.11 
 
 
234 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
232 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  47.11 
 
 
234 aa  191  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 
229 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  47.56 
 
 
231 aa  190  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 
229 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140851  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
232 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
229 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 
237 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
229 aa  187  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
233 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 
231 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 
230 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  42.11 
 
 
229 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 
233 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0204  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 
242 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00392261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
226 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  47.06 
 
 
225 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  46.61 
 
 
224 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.06 
 
 
225 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  47.06 
 
 
225 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 
225 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.06 
 
 
225 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 
236 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  45.5 
 
 
226 aa  184  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
235 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.06 
 
 
225 aa  184  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 
235 aa  184  1e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 
225 aa  184  1e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  45.74 
 
 
244 aa  184  1e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
235 aa  184  1e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 
235 aa  184  1e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 
240 aa  184  1e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 
235 aa  183  2e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 
235 aa  183  2e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 
235 aa  183  2e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 
235 aa  183  2e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 
235 aa  183  2e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.11 
 
 
231 aa  183  2e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.20296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.86 
 
 
235 aa  183  2e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.86 
 
 
235 aa  183  2e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  46.15 
 
 
233 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 
230 aa  182  4e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>