86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3747 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  97.73 
 
 		 220 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  40.26 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  34.06 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  32.42 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  32.7 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  29.19 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.08 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.02 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.02 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  27.97 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  26.99 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  26.84 
 
 		 355 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  29.38 
 
 		 890 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  29.6 
 
 		 890 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  32 
 
 		 575 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  31.7 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  28.02 
 
 		 895 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  33.17 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  35.75 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  45.78 
 
 		 777 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  28.2 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  26.02 
 
 		 878 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  31.82 
 
 		 776 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  30.65 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  49.28 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  49.28 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  49.28 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  30.82 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  27.67 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  34.2 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  45.95 
 
 		 777 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  32.03 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.98 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.28 
 
 		 678 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  26.63 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.2 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  42.53 
 
 		 777 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  25.47 
 
 		 775 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  27.13 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  24.75 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  28.9 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  31.86 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  35.08 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  30.69 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  26.63 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  43.48 
 
 		 763 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  43.48 
 
 		 763 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  29.23 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  36.18 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  32.07 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  32.07 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  31.09 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  36.84 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  33.17 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  29.25 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  33.5 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  34.04 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  25.92 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  31.4 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  38.36 
 
 		 899 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  26.86 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  30.17 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  28.93 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 929 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  31.4 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  29.44 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  30.39 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  29.44 
 
 		 351 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  30.41 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  32.54 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  40.54 
 
 		 866 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  27.37 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  34.45 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  32.26 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  34.59 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  31.37 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  29.3 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  35.71 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  32.99 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  31.46 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>