More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3605 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  276  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  51.45 
 
 
138 aa  153  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  43.7 
 
 
144 aa  120  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  43.17 
 
 
142 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  44.83 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
145 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  40.16 
 
 
139 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  43.51 
 
 
153 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 
143 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  42.62 
 
 
164 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  42.74 
 
 
139 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  39.06 
 
 
148 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  41.67 
 
 
144 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  39.37 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  41.3 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  36.8 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  41.18 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  39.39 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  41.67 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  40.34 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  39.17 
 
 
157 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  39.86 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  40.15 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  45.19 
 
 
170 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.75 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  41.88 
 
 
157 aa  90.5  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  39.13 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  40.88 
 
 
136 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  44.34 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  34.06 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  44.34 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  38.69 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  41.03 
 
 
145 aa  87  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  45 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  35.51 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  43 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  43 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  40.8 
 
 
141 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  40.17 
 
 
139 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  44 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  44 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  36.21 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  40.46 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  43 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  43 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.21 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  39.83 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  35.9 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  36.22 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.61 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  34.78 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  39.67 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  40.35 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  33.61 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  39.17 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  38.52 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  41.18 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  40.17 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  36.03 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  36.13 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  38.28 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  35.34 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  32.58 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.09 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.77 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.03 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>