More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3571 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  52.13 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  52.13 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  51.67 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  53.08 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  50.24 
 
 		 221 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  48.04 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  48.53 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  47.55 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  52.91 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  42.05 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  42.27 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  41.75 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  45.36 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  34.31 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  40.88 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  40.88 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>