47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3467 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  32.21 
 
 		 523 aa  99.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  29.44 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  48.15 
 
 		 585 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  30.49 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  25.34 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  28.57 
 
 		 505 aa  55.1  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  47.62 
 
 		 535 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  40.85 
 
 		 552 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  42.67 
 
 		 540 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  47.62 
 
 		 535 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  47.62 
 
 		 535 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  42.67 
 
 		 540 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  47.62 
 
 		 535 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  47.62 
 
 		 511 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  42.67 
 
 		 540 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  41.67 
 
 		 534 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  41.27 
 
 		 516 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  35.23 
 
 		 518 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  43.06 
 
 		 538 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  44.83 
 
 		 539 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  51.02 
 
 		 539 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  44.44 
 
 		 537 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  47.46 
 
 		 528 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  44.26 
 
 		 538 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  22.58 
 
 		 508 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  22.58 
 
 		 508 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  22.58 
 
 		 508 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  22.58 
 
 		 508 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  45.76 
 
 		 522 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  22.58 
 
 		 510 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  22.58 
 
 		 508 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  22.58 
 
 		 510 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  22.58 
 
 		 508 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  38.1 
 
 		 512 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  45 
 
 		 530 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  34.72 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  43.08 
 
 		 525 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  46.3 
 
 		 532 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  35.37 
 
 		 519 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  41.54 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  30.16 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  30.16 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  22.6 
 
 		 529 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  42.86 
 
 		 518 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  45.83 
 
 		 534 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  35.09 
 
 		 511 aa  41.6  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>