More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3458 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1216    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  43.28 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  40.73 
 
 		 575 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  40.73 
 
 		 575 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  39.9 
 
 		 584 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  36.22 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 536 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 536 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 536 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  33.82 
 
 		 537 aa  246  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  32.89 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.57 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 650 aa  233  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 601 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  31.92 
 
 		 581 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  29.36 
 
 		 604 aa  220  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  29.74 
 
 		 928 aa  220  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  29.97 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  32.68 
 
 		 648 aa  219  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  32.17 
 
 		 555 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.33 
 
 		 539 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 564 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.83 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.92 
 
 		 556 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  31.51 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  28.92 
 
 		 585 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  31.17 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.23 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  32.36 
 
 		 590 aa  199  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 554 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  30.22 
 
 		 547 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 530 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 563 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.47 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 583 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30.76 
 
 		 620 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  31.83 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  31.83 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  29.7 
 
 		 547 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.71 
 
 		 543 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  31.83 
 
 		 543 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 545 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  30.78 
 
 		 606 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.89 
 
 		 535 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.89 
 
 		 542 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 530 aa  177  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.11 
 
 		 543 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  32.77 
 
 		 556 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 592 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  29.51 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.9 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 556 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30 
 
 		 560 aa  173  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  32.01 
 
 		 569 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.58 
 
 		 564 aa  170  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.35 
 
 		 538 aa  170  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.51 
 
 		 541 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 596 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.85 
 
 		 522 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.86 
 
 		 616 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.51 
 
 		 544 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.16 
 
 		 540 aa  167  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 544 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 626 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 580 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 542 aa  165  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  30.19 
 
 		 643 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.99 
 
 		 537 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.86 
 
 		 589 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.57 
 
 		 543 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 522 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  30.31 
 
 		 551 aa  161  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.03 
 
 		 548 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.77 
 
 		 537 aa  160  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.46 
 
 		 520 aa  160  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.47 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.06 
 
 		 560 aa  159  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  25.99 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.69 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.08 
 
 		 545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.09 
 
 		 539 aa  157  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.81 
 
 		 569 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 658 aa  156  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>