28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3437 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3437  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  56.1 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  50 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000239033  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  46.33 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1551  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  42.47 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0798681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2058  hypothetical protein  41.02 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00309016  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  38.25 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000531806  unclonable  0.00000125757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2061  hypothetical protein  41.09 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00336712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  35.46 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  37.45 
 
 		 252 aa  141  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  37.45 
 
 		 252 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  36.89 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  33.73 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3109  hypothetical protein  35.95 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000053036  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  36.78 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  34.41 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3946  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  36.84 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6168  ABC cobalt transporter periplasmic binding protein CbiN  36.99 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  35.41 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  36.8 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  35.25 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000011532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.56 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.68 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  29.64 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0170  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.7 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1734  hypothetical protein  27.76 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00120517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>