98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3436 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
203 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  77.23 
 
 
208 aa  297  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  60.3 
 
 
430 aa  203  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  58.59 
 
 
211 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  54.55 
 
 
211 aa  185  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  53.2 
 
 
204 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  52.02 
 
 
197 aa  172  3e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  9.20884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  50 
 
 
208 aa  172  3e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  51.27 
 
 
201 aa  164  7e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  47.55 
 
 
204 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  50.52 
 
 
204 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.65772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  50.5 
 
 
211 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  50.5 
 
 
211 aa  153  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.5 
 
 
198 aa  130  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  1.05881e-06 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  46.27 
 
 
205 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  50.25 
 
 
204 aa  127  1e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  46.38 
 
 
207 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  41.03 
 
 
194 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40 
 
 
198 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  37.44 
 
 
195 aa  120  1e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  47.26 
 
 
205 aa  114  8e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  38.14 
 
 
193 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  37.2 
 
 
201 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  36.62 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  39.3 
 
 
197 aa  80.1  2e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.85 
 
 
241 aa  72  5e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  41.79 
 
 
231 aa  71.6  7e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.05 
 
 
352 aa  69.3  3e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.6 
 
 
246 aa  66.2  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.43 
 
 
204 aa  63.5  2e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.31 
 
 
328 aa  63.2  3e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.03 
 
 
354 aa  62  6e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.9 
 
 
213 aa  57.4  1e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  31.02 
 
 
245 aa  57.4  1e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  30.28 
 
 
230 aa  57  2e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.49 
 
 
233 aa  56.2  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.89 
 
 
235 aa  55.8  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.47 
 
 
306 aa  55.5  5e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.49 
 
 
343 aa  55.1  7e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  31.39 
 
 
226 aa  54.3  1e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.09 
 
 
333 aa  53.9  1e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  32.86 
 
 
242 aa  53.1  2e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
216 aa  53.5  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.21 
 
 
261 aa  53.5  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  27.94 
 
 
213 aa  53.5  2e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.96 
 
 
202 aa  53.5  2e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.71 
 
 
229 aa  53.1  3e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.34 
 
 
310 aa  52.4  4e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.44 
 
 
355 aa  52  5e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38373e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.11 
 
 
348 aa  52  6e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.7293e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  31.02 
 
 
256 aa  52  6e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.77 
 
 
232 aa  52  6e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  32.72 
 
 
343 aa  51.6  7e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.37 
 
 
241 aa  51.6  8e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  28.05 
 
 
226 aa  51.6  8e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.37 
 
 
241 aa  51.6  8e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.38 
 
 
326 aa  51.2  9e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.16 
 
 
218 aa  51.2  1e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.99 
 
 
347 aa  50.1  2e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.88 
 
 
421 aa  50.4  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.52 
 
 
229 aa  49.7  3e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.73 
 
 
310 aa  49.3  4e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.06 
 
 
307 aa  48.9  5e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  27.91 
 
 
214 aa  48.5  6e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  27.19 
 
 
330 aa  48.5  6e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.51 
 
 
213 aa  48.5  6e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  28.9 
 
 
212 aa  48.5  6e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.44 
 
 
232 aa  48.5  7e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1243  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.98 
 
 
233 aa  48.5  7e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.23865e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.71 
 
 
242 aa  48.5  7e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.44 
 
 
232 aa  48.5  7e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.44 
 
 
232 aa  48.5  7e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2225  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.13 
 
 
359 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000325574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.52 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.19 
 
 
331 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  28.74 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.02 
 
 
342 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.37 
 
 
348 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  33.55 
 
 
217 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.65 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0076  hypothetical protein  32.47 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.99 
 
 
299 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  26.57 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  29.09 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  30.82 
 
 
352 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.56 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  27.4 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  29.63 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  24.04 
 
 
212 aa  45.1  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  25.33 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.82 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.58 
 
 
233 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.55 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  25.62 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.19 
 
 
337 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.66 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.61 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0495  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM  40.37 
 
 
210 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>