19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3421 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  100 
 
 		 396 aa  745    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  91.92 
 
 		 396 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  91.67 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  30.56 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  36.73 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  31.82 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  34.49 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  38.71 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  31.17 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  34.8 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  38.66 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  31.92 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  31.17 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 		 609 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  29.89 
 
 		 864 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>