38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3259 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3259  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  320  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226697  normal  0.438812 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0610  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  45.65 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0596  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  45.65 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000617065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2559  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  42.76 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000186717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1773  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.78 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0423  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.26 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0040  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.07 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.66 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6142  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  32 
 
 		 619 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.87 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0089  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.78 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0702  TRAP dicarboxylate transporter, permease component  29.2 
 
 		 621 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000972925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0034  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  32.37 
 
 		 627 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4095  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  33.09 
 
 		 628 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0263  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  36.21 
 
 		 624 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5222  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.15 
 
 		 634 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.32 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0408  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.19 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5667  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  34.81 
 
 		 622 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.33 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2685  TrapT dctQ-M fusion permease, dicarboxylate transport  33.82 
 
 		 627 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2369  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  34.45 
 
 		 628 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193075  normal  0.0167467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2094  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  34.45 
 
 		 628 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386051  normal  0.0954493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5261  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  42.25 
 
 		 636 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3901  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.81 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.507253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2721  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  32.35 
 
 		 627 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3006  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.68 
 
 		 630 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0560  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  29.03 
 
 		 625 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0330  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  27.71 
 
 		 180 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1947  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.79 
 
 		 635 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1870  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.6 
 
 		 164 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2122  ArsR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0479632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1743  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.81 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2862  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.03 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.779712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3120  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  32.54 
 
 		 627 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0449  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.65 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.36 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.73 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>