More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3255 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  39.17 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  33.51 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 225 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 234 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.12 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 227 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  25.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  28.33 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>