More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3216 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.89 
 
 		 914 aa  921    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  54.8 
 
 		 911 aa  943    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 911 aa  943    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 930 aa  929    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  55.1 
 
 		 909 aa  913    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.42 
 
 		 906 aa  920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.22 
 
 		 907 aa  920    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  51.99 
 
 		 926 aa  902    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  62.06 
 
 		 912 aa  1068    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  54.8 
 
 		 911 aa  943    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  52.44 
 
 		 922 aa  907    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  54.4 
 
 		 928 aa  946    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  56.12 
 
 		 914 aa  961    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  59.96 
 
 		 912 aa  1048    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  52.09 
 
 		 906 aa  916    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  67.2 
 
 		 1071 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  56.88 
 
 		 920 aa  1004    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  61.62 
 
 		 912 aa  1062    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.27 
 
 		 913 aa  867    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  67.2 
 
 		 1082 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  53.1 
 
 		 906 aa  909    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  85.35 
 
 		 901 aa  1523    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  52.65 
 
 		 932 aa  915    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  52.42 
 
 		 906 aa  921    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  56.16 
 
 		 911 aa  923    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  55.92 
 
 		 921 aa  930    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  53.89 
 
 		 936 aa  933    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  67.2 
 
 		 1071 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  61.82 
 
 		 904 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  55.26 
 
 		 924 aa  930    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  53.48 
 
 		 994 aa  923    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  54.05 
 
 		 936 aa  935    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  54.8 
 
 		 911 aa  943    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  53.76 
 
 		 916 aa  912    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  85.46 
 
 		 901 aa  1524    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  67 
 
 		 1017 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  54.19 
 
 		 913 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  55.97 
 
 		 929 aa  939    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  56.85 
 
 		 925 aa  956    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  54.8 
 
 		 911 aa  942    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  66.21 
 
 		 1066 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  56.33 
 
 		 933 aa  968    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  54.53 
 
 		 930 aa  944    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  67.2 
 
 		 1079 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  54.69 
 
 		 911 aa  942    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  55.25 
 
 		 930 aa  919    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  56.71 
 
 		 927 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  53.98 
 
 		 921 aa  909    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  53.87 
 
 		 922 aa  912    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  60.51 
 
 		 917 aa  1083    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  1802    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  55.16 
 
 		 927 aa  904    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  54.19 
 
 		 913 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  52.93 
 
 		 908 aa  881    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  54.74 
 
 		 911 aa  942    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  55.25 
 
 		 919 aa  942    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  55.9 
 
 		 916 aa  947    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  52.42 
 
 		 942 aa  907    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  52.05 
 
 		 935 aa  912    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  53.46 
 
 		 943 aa  936    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  54.96 
 
 		 927 aa  944    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  54.3 
 
 		 913 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  52.03 
 
 		 918 aa  920    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  54.76 
 
 		 936 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  54.84 
 
 		 911 aa  929    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  55.58 
 
 		 918 aa  914    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  53.58 
 
 		 942 aa  875    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  55.68 
 
 		 916 aa  926    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  61.84 
 
 		 912 aa  1048    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  54.3 
 
 		 913 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  53.9 
 
 		 915 aa  935    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  54.8 
 
 		 911 aa  942    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  58.58 
 
 		 912 aa  939    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  56.51 
 
 		 901 aa  939    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  66.73 
 
 		 1089 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  54.8 
 
 		 911 aa  943    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.86 
 
 		 651 aa  399  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  43.97 
 
 		 512 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  44.66 
 
 		 510 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  43.46 
 
 		 578 aa  392  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  42.45 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  40.77 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  40.43 
 
 		 575 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  37.01 
 
 		 580 aa  356  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  37.19 
 
 		 580 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40 
 
 		 593 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  38.16 
 
 		 590 aa  353  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  40.76 
 
 		 588 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.98 
 
 		 576 aa  351  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38.14 
 
 		 590 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  38.11 
 
 		 580 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 580 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  38.69 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  38.09 
 
 		 579 aa  348  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  39.65 
 
 		 578 aa  347  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 592 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  40 
 
 		 592 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  38.37 
 
 		 587 aa  345  2e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 578 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>