168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3103 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  78.48 
 
 		 660 aa  956    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  78.94 
 
 		 660 aa  962    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  100 
 
 		 675 aa  1280    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  35.79 
 
 		 656 aa  344  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  32.63 
 
 		 646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  28.22 
 
 		 677 aa  225  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  29.85 
 
 		 709 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  30.6 
 
 		 696 aa  167  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  26.61 
 
 		 640 aa  153  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  28.03 
 
 		 732 aa  148  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  26.33 
 
 		 699 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  34.55 
 
 		 655 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.99 
 
 		 643 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.8 
 
 		 742 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  23.11 
 
 		 695 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  32.99 
 
 		 705 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.16 
 
 		 645 aa  138  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  26.43 
 
 		 656 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  31.79 
 
 		 649 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  24.6 
 
 		 703 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.31 
 
 		 606 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.46 
 
 		 695 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  27.02 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  22.42 
 
 		 606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  30.93 
 
 		 649 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.54 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.04 
 
 		 606 aa  124  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  24.36 
 
 		 648 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  24.12 
 
 		 614 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  24.53 
 
 		 606 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  30.28 
 
 		 602 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.14 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  29.88 
 
 		 1013 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  23.94 
 
 		 607 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  24.01 
 
 		 655 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  27.49 
 
 		 654 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  23.82 
 
 		 606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.17 
 
 		 612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  30 
 
 		 608 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  24.22 
 
 		 654 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  24.56 
 
 		 649 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  26.47 
 
 		 632 aa  107  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.06 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  29.92 
 
 		 893 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  31.19 
 
 		 797 aa  98.6  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  30.37 
 
 		 607 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  30.37 
 
 		 607 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  25.57 
 
 		 640 aa  97.4  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  25.84 
 
 		 812 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  27.27 
 
 		 604 aa  94  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  24.18 
 
 		 682 aa  92.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  31.11 
 
 		 607 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  23.99 
 
 		 670 aa  87.8  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.66 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  25.27 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  25.2 
 
 		 657 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  25.69 
 
 		 826 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  31.49 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  32.97 
 
 		 599 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  26.59 
 
 		 608 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  24.5 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  22.06 
 
 		 741 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  24.96 
 
 		 649 aa  72  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  24 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.79 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  21.42 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  32.1 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  29.47 
 
 		 737 aa  67.8  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  34.04 
 
 		 599 aa  67  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  23.3 
 
 		 741 aa  67  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.25 
 
 		 794 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  30.84 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  28.32 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  26.97 
 
 		 789 aa  64.7  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  23.37 
 
 		 664 aa  64.3  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.35 
 
 		 711 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  23.65 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  23.85 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1217 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  24.34 
 
 		 678 aa  63.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  21.3 
 
 		 656 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  21.13 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.09 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  30.72 
 
 		 604 aa  60.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.84 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  32.18 
 
 		 677 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.36 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  21.9 
 
 		 603 aa  58.9  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  30.47 
 
 		 1077 aa  57.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  29.17 
 
 		 691 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  25.13 
 
 		 762 aa  56.6  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  25.21 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  23.32 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  22.53 
 
 		 502 aa  55.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.53 
 
 		 508 aa  55.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  27.13 
 
 		 747 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  25.66 
 
 		 634 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  24.67 
 
 		 761 aa  53.5  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  29.92 
 
 		 618 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  29.92 
 
 		 618 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>