58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3090 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  745    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  88.28 
 
 		 393 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  88.01 
 
 		 367 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  53.97 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  56.05 
 
 		 357 aa  330  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  47.76 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  49.06 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  37.78 
 
 		 345 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  42.31 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  36.34 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  42.11 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  37.4 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  37.4 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  37.64 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  34.97 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  42.11 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  37.4 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  34.36 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  34.05 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  35.14 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  36.46 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  35.45 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  35.45 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  31.96 
 
 		 523 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  34.53 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  33.91 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  34 
 
 		 595 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  35.34 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  35.81 
 
 		 530 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  31.92 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  29.63 
 
 		 721 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  36.04 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  30.22 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  31.51 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  29.84 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  30.1 
 
 		 566 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  30.36 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  30.11 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  28.85 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  31.54 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  28.08 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  28.12 
 
 		 831 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  28.38 
 
 		 777 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 632 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  28.85 
 
 		 746 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  32.7 
 
 		 503 aa  76.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  28.24 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  28.17 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  25.9 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  29.19 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  25.17 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  25.72 
 
 		 726 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  28.7 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  29.77 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  32 
 
 		 733 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  26.06 
 
 		 800 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.74 
 
 		 935 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>