More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3066 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  95.11 
 
 
348 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  94.54 
 
 
348 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
348 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  78.16 
 
 
348 aa  544  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  76.52 
 
 
349 aa  521  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.52 
 
 
348 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  76.52 
 
 
353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.14 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.86 
 
 
357 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.23 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.52 
 
 
359 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.29 
 
 
355 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.52 
 
 
359 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.86 
 
 
355 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.59 
 
 
357 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.33 
 
 
356 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.77 
 
 
368 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.02 
 
 
357 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.74 
 
 
357 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.84 
 
 
357 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.75 
 
 
388 aa  421  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.02 
 
 
357 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.46 
 
 
357 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.08 
 
 
361 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.31 
 
 
357 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.35 
 
 
356 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.86 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.67 
 
 
355 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.5 
 
 
353 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.99 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.14 
 
 
359 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.53 
 
 
355 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.08 
 
 
356 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.25 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.02 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.61 
 
 
352 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.76 
 
 
345 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.85 
 
 
346 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.38 
 
 
346 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.58 
 
 
369 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.65 
 
 
346 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.23 
 
 
347 aa  381  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.17 
 
 
358 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.01 
 
 
345 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  54.34 
 
 
802 aa  378  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.25 
 
 
346 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.53 
 
 
345 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 
346 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.98 
 
 
358 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.94 
 
 
363 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.49 
 
 
345 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61 
 
 
341 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.21 
 
 
345 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.23 
 
 
345 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.36 
 
 
345 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.7 
 
 
351 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.69 
 
 
356 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.21 
 
 
346 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.82 
 
 
345 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.4 
 
 
345 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.49 
 
 
354 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.72 
 
 
359 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.93 
 
 
350 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.01 
 
 
345 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.01 
 
 
346 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
345 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
345 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.56 
 
 
347 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.51 
 
 
345 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
352 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.19 
 
 
345 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.28 
 
 
345 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.01 
 
 
348 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.51 
 
 
345 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.9 
 
 
352 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.51 
 
 
345 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.89 
 
 
347 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.89 
 
 
347 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.87 
 
 
363 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.67 
 
 
345 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.97 
 
 
350 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.06 
 
 
345 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.21 
 
 
345 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.67 
 
 
345 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.28 
 
 
349 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.67 
 
 
345 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.67 
 
 
345 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.06 
 
 
350 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.79 
 
 
379 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.67 
 
 
345 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.24 
 
 
368 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.06 
 
 
345 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.57 
 
 
349 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  51.91 
 
 
795 aa  365  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.12 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.06 
 
 
345 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.06 
 
 
350 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.97 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  56.67 
 
 
345 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>