149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2954 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 342 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  84.21 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  85.4 
 
 		 341 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  47.46 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  48.65 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  45.89 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  49.35 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  41.64 
 
 		 506 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  43.06 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  40.06 
 
 		 506 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  41.8 
 
 		 549 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  42.33 
 
 		 529 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  42.82 
 
 		 514 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  44.01 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  47.74 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  39.55 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  47.34 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  42.57 
 
 		 540 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  39.23 
 
 		 507 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  39.34 
 
 		 509 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  42.94 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  41.86 
 
 		 542 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  44.73 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  39.5 
 
 		 505 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  42.48 
 
 		 529 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  38.33 
 
 		 507 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  45.15 
 
 		 472 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  40.78 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  38.66 
 
 		 523 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  37.22 
 
 		 523 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  34.59 
 
 		 562 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  38.82 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  33.43 
 
 		 497 aa  158  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  39.46 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  33.05 
 
 		 504 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  34.59 
 
 		 513 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  33.14 
 
 		 498 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  34.3 
 
 		 513 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  31.58 
 
 		 503 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  36.3 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  32.06 
 
 		 505 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  32.94 
 
 		 509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  35.74 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  35.44 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  32.74 
 
 		 502 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  36.36 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  35.55 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  37.94 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  31.05 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  31.1 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  32.48 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  32.73 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  35.02 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  32.25 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  32.65 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  34.75 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  34.54 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  31.52 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  33.57 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  33.88 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  33.1 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  33.1 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  36.79 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  34.36 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  32.45 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  36.24 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  35.14 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  36.24 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  35.64 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  34.84 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  32.42 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  36.08 
 
 		 346 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  31.35 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>