More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2953 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  84.55 
 
 		 221 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  86.24 
 
 		 221 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  52.23 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  50.91 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  53.33 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  44.02 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  47.62 
 
 		 252 aa  171  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  46.61 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  45.22 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  44.26 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  44.16 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  42.61 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  41.63 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  43.36 
 
 		 248 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  45.22 
 
 		 255 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  42.17 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  41.48 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  43.16 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  41.15 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  39.15 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  40.09 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  40.09 
 
 		 248 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  37.39 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  39.91 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  39.65 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  37.83 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  39.47 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  38.43 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  37.45 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  38.08 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  38.29 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  40.44 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  40.64 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  39.09 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  39.09 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  39.09 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  37.73 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  38.36 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  38.81 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  37.93 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  35.06 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  35.68 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  29.52 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  35.62 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  35.75 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  38.18 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  35.35 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  35.35 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  34.63 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  35.84 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  37.38 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  34.63 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  34.63 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  34.63 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  34.63 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  34.63 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  35.14 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  35.59 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  34.63 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  32.42 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  34.65 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  33.65 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  35.04 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  32.02 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  31.63 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  33.96 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  32.59 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  30.45 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  34.45 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  32.91 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  34.11 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>