178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2917 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  285  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  90.51 
 
 
137 aa  261  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  89.78 
 
 
141 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  69.34 
 
 
142 aa  209  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  69.34 
 
 
142 aa  209  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  67.88 
 
 
144 aa  204  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  68.89 
 
 
140 aa  203  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  68.38 
 
 
141 aa  201  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  65.69 
 
 
142 aa  199  8e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  68.12 
 
 
143 aa  199  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  66.42 
 
 
137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  67.15 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  68.12 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  65.94 
 
 
143 aa  196  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  67.39 
 
 
143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  65.69 
 
 
139 aa  194  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  59.85 
 
 
141 aa  177  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  62.77 
 
 
137 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  59.85 
 
 
137 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  62.04 
 
 
138 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  62.5 
 
 
140 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  62.5 
 
 
140 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  61.31 
 
 
137 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  62.5 
 
 
139 aa  173  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  57.66 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  58.39 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  58.39 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  58.39 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  57.66 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  60.29 
 
 
138 aa  167  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  55.47 
 
 
137 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  56.93 
 
 
139 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  57.66 
 
 
137 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  57.78 
 
 
144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  55.47 
 
 
163 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  51.82 
 
 
135 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  50.98 
 
 
156 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  48.53 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  45.03 
 
 
173 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  44.37 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  46.36 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  45.1 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  46.67 
 
 
137 aa  120  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  45.11 
 
 
138 aa  120  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  120  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  48.48 
 
 
139 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  48.15 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  43.14 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  45.59 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  44.08 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  45.33 
 
 
160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  51.13 
 
 
141 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  42.76 
 
 
156 aa  116  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  46.53 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  46.53 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  43.71 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  40.88 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  45.83 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  42.11 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  42.11 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  40.74 
 
 
142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  43.71 
 
 
153 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  41.72 
 
 
153 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  42.18 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  40.74 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  43.71 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  43.71 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  43.71 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  43.06 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  40.4 
 
 
154 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  42.11 
 
 
158 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  42.75 
 
 
133 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  42.96 
 
 
148 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  37.09 
 
 
152 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  41.33 
 
 
149 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  36.42 
 
 
152 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  40.13 
 
 
154 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  37.75 
 
 
157 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  35.53 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  35.53 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  40.4 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  38.93 
 
 
158 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  39.47 
 
 
165 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  40.67 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  42.38 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  36.84 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2375  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  42 
 
 
194 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2507  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  42 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1847  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2458  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2463  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.563467  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1521  hypothetical protein  35.76 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0365947  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16301  hypothetical protein  35.57 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  36.6 
 
 
155 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>