More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2796 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  550  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  93.17 
 
 		 293 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  92.83 
 
 		 293 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.93 
 
 		 288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  65.98 
 
 		 305 aa  316  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  62.85 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  55.63 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  40.29 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  35.74 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  32.26 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  30.32 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 306 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  30.6 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  30.69 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.8 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.82 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.82 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.82 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.82 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.82 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.73 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.15 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.66 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.44 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.53 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.44 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  31.14 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  30.07 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  27.46 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  27.46 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  27.46 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  27.46 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  27.46 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  27.46 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  27.46 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  30.8 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  26.3 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.88 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  26.3 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  29.39 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.64 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  33.7 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  26.38 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  26.96 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  26.38 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.24 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.88 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  25.98 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  27.17 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.09 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  27.33 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  26.6 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  29.24 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  27.64 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  26.77 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  21.75 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.7 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.75 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.31 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  26.92 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.36 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.62 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.75 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.18 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.68 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.75 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  26.1 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  25.08 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.4 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  21.68 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  30.07 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  30.04 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.37 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.49 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  31.34 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.08 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  29.09 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.75 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.45 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  28.26 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  34.38 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  21.75 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>