19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2773 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1154  hypothetical protein  81.86 
 
 
204 aa  317  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2815  hypothetical protein  81.86 
 
 
204 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447323  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2607  hypothetical protein  42.49 
 
 
193 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0227  hypothetical protein  35.2 
 
 
198 aa  118  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0026  hypothetical protein  38.97 
 
 
199 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3851  hypothetical protein  27.92 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.855967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3587  hypothetical protein  32.83 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  24.75 
 
 
239 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  34.33 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  31.03 
 
 
246 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  26.4 
 
 
258 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  28.14 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  30.83 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  28.14 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  30.83 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  28.36 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  26.81 
 
 
233 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>