22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2698 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1260  hypothetical protein  84.31 
 
 		 153 aa  257  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2920  hypothetical protein  84.31 
 
 		 153 aa  257  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3148  hypothetical protein  57.97 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.486705 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3419  hypothetical protein  53.19 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6198  hypothetical protein  53.19 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1687  hypothetical protein  36.69 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3778  hypothetical protein  37.04 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119444  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  34.07 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3562  hypothetical protein  30.63 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  28.1 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  26.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  26.17 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  29.76 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  30.12 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4126  hypothetical protein  29.52 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  30.3 
 
 		 317 aa  40.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>