287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2633 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  85.36 
 
 		 240 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  85.77 
 
 		 240 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  58.97 
 
 		 243 aa  271  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  53.53 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  50.63 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  50 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  37.45 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 		 215 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  38.2 
 
 		 270 aa  141  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  39.21 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  40.26 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 		 271 aa  138  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  39.48 
 
 		 271 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  41.13 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  34.87 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  38.36 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.92 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  37.39 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.92 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  35.59 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  32.49 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  37.39 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  34.71 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  36.64 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 		 268 aa  118  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  38.56 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  27.47 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.18 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.98 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.43 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  36.44 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.51 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  36.78 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.91 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.08 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  36.94 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.87 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  36.36 
 
 		 299 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.85 
 
 		 296 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.91 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  31.7 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.91 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.42 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  34.19 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  25.74 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.76 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  32.07 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  32.79 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.48 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.77 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  30.14 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.17 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  25.42 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  32.17 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.33 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.33 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  33.77 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  33.74 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  34.96 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  45.69 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  28.69 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  45.69 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28.39 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  32.5 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  29.92 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>