23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2581 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  290  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  86.67 
 
 		 150 aa  234  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  86.67 
 
 		 150 aa  233  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  63.76 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  62.33 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  51.68 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  35.37 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  35.62 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  28.95 
 
 		 469 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  32.32 
 
 		 309 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  34.97 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  34.97 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  33.62 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  29.3 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  32.14 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3156  hypothetical protein  34.31 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3480  hypothetical protein  34.31 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  33.79 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  33.83 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>