More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2522 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  94.62 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  94.62 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  86.02 
 
 		 186 aa  333  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  79.68 
 
 		 187 aa  311  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  74.33 
 
 		 187 aa  291  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  71.89 
 
 		 186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  69.35 
 
 		 185 aa  277  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  71.02 
 
 		 185 aa  270  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  71.02 
 
 		 185 aa  270  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  68.72 
 
 		 243 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  69.06 
 
 		 185 aa  268  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  71.02 
 
 		 185 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 185 aa  267  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  67.2 
 
 		 186 aa  267  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 		 185 aa  265  4e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  69.95 
 
 		 185 aa  264  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 192 aa  262  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 197 aa  261  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  64.48 
 
 		 185 aa  260  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 188 aa  257  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 193 aa  257  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  68.31 
 
 		 185 aa  256  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 188 aa  256  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  64.84 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  67.21 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 		 185 aa  254  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  64.29 
 
 		 188 aa  251  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  63.44 
 
 		 189 aa  251  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 185 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 193 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  60.22 
 
 		 185 aa  244  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 186 aa  243  8e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  62.07 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>