171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2320 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  100 
 
 		 180 aa  333  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  82.32 
 
 		 181 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  81.77 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  48.5 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  44.71 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  50.58 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  50.58 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  44.12 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  47.16 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  49.71 
 
 		 197 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  59.2 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  55.83 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  40.22 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  40.22 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  46.47 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  46.47 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  43.43 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  46.47 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  46.47 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  46.47 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  45.56 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  40.12 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  43.33 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  46.63 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  44.12 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  42.22 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  43.75 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  37.58 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  54.62 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  48.55 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  50.86 
 
 		 215 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  46.54 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  38.82 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  43.48 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  43.48 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  43.48 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  43.31 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  48.12 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  46.59 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  46.59 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  38.38 
 
 		 231 aa  97.8  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  42.86 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  38.67 
 
 		 224 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  37.79 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  40.35 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.55 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.85 
 
 		 216 aa  90.9  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  43.9 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  50.64 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  38.69 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  43.07 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.16 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.33 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.57 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  41.33 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  38.29 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  38.82 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  35.09 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  53.05 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  33.96 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  39.66 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  37.64 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.73 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  41.3 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.66 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.66 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  38.93 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.76 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  34.19 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  37.29 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  36.77 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  43.09 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  36.09 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.29 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.41 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  30.12 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  31.72 
 
 		 203 aa  72  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.98 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  34.32 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.08 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  39.44 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  31.21 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  33.91 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  38.61 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  37.58 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  36.78 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  39.88 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  34.05 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  30.41 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  40.28 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  33.76 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.89 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  39.39 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  37.79 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  33.86 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  31.58 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  31.58 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  32.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.18 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>