197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2309 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  81.31 
 
 		 214 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  81.31 
 
 		 226 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  44.2 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  44.64 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  45.41 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  40.38 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  49.34 
 
 		 161 aa  128  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  38.32 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  36.7 
 
 		 358 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  35.66 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  36.73 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  38.05 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  41.29 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  34.96 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  44.08 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  42.68 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  35.91 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  40.35 
 
 		 171 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  41.89 
 
 		 167 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  42.57 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  45 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  35.56 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  43.42 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  39.86 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  46.27 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  39.31 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  40.27 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  31.84 
 
 		 246 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  45.95 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  41.61 
 
 		 534 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  36.77 
 
 		 168 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.19 
 
 		 148 aa  88.6  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  32.45 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.67 
 
 		 175 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  33.73 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  32.45 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  38.97 
 
 		 171 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  36.13 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  35.29 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  42.75 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32 
 
 		 175 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.04 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  44.29 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  33.64 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.54 
 
 		 388 aa  81.6  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  31.98 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.33 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  41.22 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  33.78 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  34 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  36.36 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  33.78 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  38.21 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  31.8 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  42.28 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.71 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.05 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.52 
 
 		 153 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  37.42 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  37.42 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.14 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  39.37 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.11 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  44.54 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.61 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.43 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  32.4 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.3 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  34.27 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  40.82 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.12 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  35.03 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  29.94 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.68 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  29.63 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.3 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.75 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.91 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.97 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  32.17 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.06 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.88 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.11 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  32.24 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.89 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  34.38 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  38.13 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  36.84 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.79 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>