34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2278 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  98.68 
 
 
151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  98.51 
 
 
134 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  72.19 
 
 
151 aa  237  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  71.52 
 
 
151 aa  230  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  76.82 
 
 
151 aa  230  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  70.86 
 
 
151 aa  219  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  49.67 
 
 
168 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
163 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  44 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  40.94 
 
 
163 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  42.67 
 
 
164 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  44 
 
 
162 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  41.33 
 
 
164 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  44.67 
 
 
179 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  41.33 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  43.79 
 
 
158 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  41.33 
 
 
173 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  40 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  41.61 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  39.33 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  43.71 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  42.57 
 
 
185 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  39.33 
 
 
164 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
167 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  36.67 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  36.24 
 
 
164 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  39.33 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  35.37 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  37.04 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.82 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  23.84 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>