More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2257 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 368 aa  727    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  85.6 
 
 		 368 aa  564  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  85.33 
 
 		 368 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  54.93 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 		 407 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  44.07 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 351 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  39.37 
 
 		 364 aa  216  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 		 354 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  42.23 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  36.48 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2688  secretion protein HlyD family protein  43.69 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  36.5 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  36.69 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  36.06 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  35.33 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  38.26 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.18 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  38.12 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  39.68 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  36.06 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.58 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.8 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  36.2 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  37.03 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.53 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.75 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  34.16 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.88 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  34.66 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  37.75 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.7 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  34.16 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  35.29 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  35.29 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1853  multidrug resistance transmembrane protein  36.55 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  36.31 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  37.66 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  34.8 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  37.66 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  37.68 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  36.04 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  35 
 
 		 390 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  34.5 
 
 		 351 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  36.73 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  34.47 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  37.68 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  37.36 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  36.44 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 397 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  37.19 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.89 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  36.01 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  36.01 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  36.01 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  36.01 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  36.01 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  36.01 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  36.01 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  35.82 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  35.73 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  35.39 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  35.69 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  34 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>