More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1993 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  52.88 
 
 
666 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  92.22 
 
 
720 aa  1273    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  70.56 
 
 
685 aa  1018    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.12 
 
 
704 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  92.36 
 
 
720 aa  1275    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  57.46 
 
 
663 aa  751    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  51.06 
 
 
643 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  67.68 
 
 
711 aa  969    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
715 aa  1440    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  69.37 
 
 
706 aa  1010    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  52.05 
 
 
681 aa  651    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2233  NADH dehydrogenase subunit L  72.47 
 
 
703 aa  974    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.61 
 
 
712 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  52.44 
 
 
695 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  61.3 
 
 
664 aa  601  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  61.19 
 
 
662 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  60.31 
 
 
666 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  59.21 
 
 
661 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  59.02 
 
 
661 aa  591  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  58.69 
 
 
664 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2996  NADH dehydrogenase subunit L  50.73 
 
 
683 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  56.72 
 
 
689 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  64.02 
 
 
683 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.38 
 
 
666 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  60.95 
 
 
654 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  64.02 
 
 
701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  63.26 
 
 
688 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.78 
 
 
681 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60 
 
 
643 aa  565  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.16 
 
 
641 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  63.81 
 
 
688 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  63.18 
 
 
697 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  62.63 
 
 
697 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  53.65 
 
 
694 aa  542  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.04 
 
 
637 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.28 
 
 
705 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.95 
 
 
703 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.95 
 
 
703 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.76 
 
 
650 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.09 
 
 
642 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.02 
 
 
702 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  54.94 
 
 
614 aa  512  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.2 
 
 
701 aa  512  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  42.44 
 
 
657 aa  505  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  42.44 
 
 
657 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.67 
 
 
675 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  44.24 
 
 
654 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.24 
 
 
660 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  41.9 
 
 
679 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 
679 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 
679 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  41.9 
 
 
679 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 
679 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 
679 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  41.6 
 
 
682 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  41.9 
 
 
679 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.88 
 
 
671 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.85 
 
 
678 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.96 
 
 
653 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.16 
 
 
646 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.94 
 
 
682 aa  492  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  41.58 
 
 
692 aa  492  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.88 
 
 
679 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  40.53 
 
 
695 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.33 
 
 
658 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.35 
 
 
666 aa  489  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.23 
 
 
676 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.11 
 
 
675 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  41.87 
 
 
695 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  49.63 
 
 
650 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  41.8 
 
 
684 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  41.71 
 
 
684 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.87 
 
 
674 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.83 
 
 
671 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.01 
 
 
672 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  41.76 
 
 
684 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  41.8 
 
 
684 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  41.85 
 
 
684 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  41.8 
 
 
684 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  41.67 
 
 
684 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  52.6 
 
 
621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.71 
 
 
667 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  41.04 
 
 
689 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  40.54 
 
 
724 aa  469  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.79 
 
 
642 aa  465  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  51 
 
 
621 aa  463  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  40.53 
 
 
719 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.24 
 
 
667 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41 
 
 
667 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.99 
 
 
628 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.87 
 
 
652 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  40.19 
 
 
713 aa  452  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  40.05 
 
 
713 aa  452  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.18 
 
 
642 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.89 
 
 
630 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.28 
 
 
670 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  48.73 
 
 
686 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  49.12 
 
 
692 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  48.34 
 
 
686 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  45.74 
 
 
670 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>