221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1959 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 329 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  81.37 
 
 		 329 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  79.64 
 
 		 329 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  57.46 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  54.81 
 
 		 330 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  51.88 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  52.66 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  49.53 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  48.12 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  42.17 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  32.02 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  30.65 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  36.86 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  29.3 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  32.7 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  32.01 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.03 
 
 		 822 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.64 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.98 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  27.27 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.56 
 
 		 1099 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  28.29 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.84 
 
 		 1154 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  22.93 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  29.3 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.23 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 624 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 		 509 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  29.8 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 450 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 1124 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 1359 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 477 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  31.43 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  26.94 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 226 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  24.88 
 
 		 332 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 		 864 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.78 
 
 		 1644 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.78 
 
 		 1644 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  28.18 
 
 		 259 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 703 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.2 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  22.08 
 
 		 1739 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 789 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 789 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 694 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>