More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1870 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  373  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  85.87 
 
 
184 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  85.33 
 
 
184 aa  325  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  64.8 
 
 
179 aa  238  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  66.86 
 
 
180 aa  237  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  64.74 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  53.26 
 
 
198 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  48.31 
 
 
193 aa  180  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  48.91 
 
 
200 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  49.45 
 
 
198 aa  175  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  46.52 
 
 
200 aa  175  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0990  hypothetical protein  48.04 
 
 
194 aa  174  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  46.33 
 
 
194 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  45.05 
 
 
201 aa  174  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  43.58 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  48.33 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  42.86 
 
 
199 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  44.02 
 
 
200 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  44.63 
 
 
194 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  45.2 
 
 
194 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  48.09 
 
 
200 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  48.09 
 
 
200 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  45.76 
 
 
193 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  45.76 
 
 
193 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  45.76 
 
 
193 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  45.76 
 
 
193 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  45.76 
 
 
193 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  45.45 
 
 
195 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  43.65 
 
 
217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  44.89 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  46.63 
 
 
197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  45.45 
 
 
195 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  41.34 
 
 
199 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  45.45 
 
 
195 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  45.45 
 
 
195 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  45.45 
 
 
195 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  43.58 
 
 
210 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  45.56 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  43.58 
 
 
211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  45.16 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  43.26 
 
 
185 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  45.2 
 
 
200 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  44.07 
 
 
194 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  44.07 
 
 
194 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  42.54 
 
 
206 aa  161  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  44.38 
 
 
217 aa  161  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  43.5 
 
 
207 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  46.24 
 
 
197 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  44.16 
 
 
204 aa  158  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  42.05 
 
 
193 aa  158  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  42.22 
 
 
207 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  44.94 
 
 
199 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  38.42 
 
 
188 aa  157  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4183  hypothetical protein  45.6 
 
 
202 aa  157  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  44.72 
 
 
194 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  44.89 
 
 
196 aa  157  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  44.38 
 
 
200 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  45.2 
 
 
195 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  45.51 
 
 
195 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  45.4 
 
 
197 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  47.06 
 
 
190 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  49.38 
 
 
195 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  46.78 
 
 
180 aa  155  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  49.38 
 
 
195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  43.09 
 
 
196 aa  154  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  41.48 
 
 
186 aa  154  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  43.75 
 
 
235 aa  154  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  41.21 
 
 
199 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  38.64 
 
 
188 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  38.64 
 
 
188 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1111  hypothetical protein  42.54 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  45.91 
 
 
205 aa  150  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  39.66 
 
 
194 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  45.09 
 
 
193 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  44.89 
 
 
195 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  39.11 
 
 
194 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  39.11 
 
 
194 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  44.89 
 
 
195 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  43.1 
 
 
195 aa  148  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  45.98 
 
 
203 aa  148  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  41.52 
 
 
200 aa  147  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  41.34 
 
 
194 aa  147  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  44 
 
 
192 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  40.68 
 
 
196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  48.21 
 
 
189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  41.11 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  47.1 
 
 
197 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  47.1 
 
 
197 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  40.46 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  41.04 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2689  hypothetical protein  47.51 
 
 
194 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0257204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  42.7 
 
 
193 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  41.67 
 
 
230 aa  143  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  38.76 
 
 
192 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  38.29 
 
 
178 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  41.9 
 
 
197 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  45.09 
 
 
193 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>