164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1561 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  83.16 
 
 
190 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  82.86 
 
 
175 aa  295  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50 
 
 
188 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  49.35 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  45.55 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  49.46 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  44.65 
 
 
221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  43.95 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 
221 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  43.31 
 
 
226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  41.98 
 
 
192 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.95 
 
 
220 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  42.68 
 
 
224 aa  124  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
203 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 
194 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  40.82 
 
 
229 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  40.82 
 
 
209 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  41.56 
 
 
205 aa  111  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
204 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.58 
 
 
202 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 
202 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 
211 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.58 
 
 
201 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
290 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  35.06 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  34.39 
 
 
261 aa  95.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  39.1 
 
 
307 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.18 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
156 aa  89  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.83 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  34.15 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.25 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  26.75 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.14 
 
 
289 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
4079 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.74 
 
 
295 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
290 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
291 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  33.73 
 
 
269 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
236 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30 
 
 
398 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.03 
 
 
560 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
286 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.61 
 
 
635 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 
286 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
279 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
265 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
295 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.88 
 
 
1138 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
3560 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
301 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
292 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
292 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
284 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.85 
 
 
1694 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 
356 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 
435 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
1276 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.55 
 
 
462 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
361 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
3035 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
371 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
512 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
628 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2309  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
278 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.61 
 
 
839 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1420  Tetratricopeptide domain protein  30.4 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
547 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
750 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
352 aa  45.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.13 
 
 
417 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
499 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
574 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  24.27 
 
 
349 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
713 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  29.17 
 
 
577 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
344 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 
1056 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
543 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.58 
 
 
479 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.04 
 
 
564 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
649 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>