24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1426 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 801 aa  1640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  36.58 
 
 		 689 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  27.69 
 
 		 780 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  26.84 
 
 		 754 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  25.68 
 
 		 704 aa  82.8  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  24.54 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  25.97 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  24.87 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  23.5 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 782 aa  68.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  28.57 
 
 		 740 aa  60.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  21.45 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  26.88 
 
 		 665 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  22 
 
 		 552 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  24.53 
 
 		 670 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  26.32 
 
 		 774 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  25.34 
 
 		 715 aa  49.3  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  23.97 
 
 		 547 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0016  hypothetical protein  29.15 
 
 		 662 aa  48.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  21.3 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  28.65 
 
 		 567 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  24.5 
 
 		 651 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  23.42 
 
 		 487 aa  45.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  25.7 
 
 		 738 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>